民航局表示，為儘早掌握旅客訂位情形及加速清艙作業，以利規劃後續加班機運能，訂票日起3日內應完成開票（例如3月9日訂票者，應於3月11日前完成開票），提醒旅客應注意開票期限，以確保自身權益。另各航線離峰日期及時段航班均尚有空位，建議民眾於無法取得首選航班機位時，可考慮其他次佳日期或離峰時段優惠機票航班，除可省卻候補機位之時間辛勞，並避開擁擠人潮。
為使空運資源作最有效之利用，避免因部分旅客重複訂位以致影響其他真正有需求民眾之權益，各航空公司仍將循往例於機票上加註「限當日當班次有效」及「逾期作廢」之使用限制。而考量清明節期間旅客搭機需求具有方向性，爰針對此次清明節假期，於尖峰時段109年4月1日至3日臺灣出發往離島方向，以及109年4月4日至4月6日離島出發回臺灣方向之機票，均會加註「限當日當班次有效」及「逾期作廢」之使用限制，俾使有限之空運資源獲得更有效之利用。退票期限規定亦為「最遲於航班起飛前辦理退票」，如因故無法搭乘原訂航班時，務必於航班起飛前通知航空公司取消訂位，並至原開票處依原機票規定辦理退票，另提醒旅客避免重複訂票，因退票時，航空公司將依機票使用規定收取票價10%之退票費用。
第二波加班機開放訂位各航空公司受理訂位電話及網址：
立榮航空公司 (02)2508-6999 https://www.uniair.com.tw/rwd/index.aspx
華信航空公司 412-8008(手機加撥02) https://www.mandarin-airlines.com/