車船處就交通船旅客使用之候船室，運用多媒體看板、跑馬燈、海報等加強旅客衛教宣導及提供消毒水給需要的旅客使用，對於登船前有發燒、咳嗽旅客呼籲主動告知及戴口罩，並確實做好候船室及船舶清潔消毒作業。
車船處表示：自2019新型冠狀病毒(武漢肺炎)疫情爆發以來，為防範疫情滲入澎湖，該處交通船實務上早已嚴格執行購票帶口罩、上船量測體溫，並備有酒精供消毒，候船室及船艙每日酒精擦拭清潔1次以上。同時所屬南海之星等2艘交通船由高雄返航澎湖時，也嚴格執行體溫量測，如發現有咳嗽及發燒之乘客會先予以隔離至貴賓室乘坐，並將此乘客名單提報衛生局列管。
△南海之星2號開航前清潔消毒工作。