縣府教育處為有效掌握各校疫情通報管理機制，請督學到各校督導視察防疫狀況，對各校的積極防疫作為表示肯定，另教育處制定「澎湖縣政府所屬學校、幼兒園及補習班因應中國大陸新型冠狀病毒肺炎疫情防疫及健康管理措施」利於規範，並依業務屬性製作了肺炎防疫作業QA供各校參考運用。學校於開學前應成立防疫小組，請家長主動關心子女身體健康，學校可利用簡訊、line預先發送防疫通知，提醒家長及學生注意事項，另寒假期間學習扶助及課業輔導一律停辦。其餘學生活動之進行，做好防護措施。學生在校期間亦須備妥防疫物資，強化衛生教育宣導，常態性環境及清潔消毒。加強通報作業，如發現疑似感染新型冠狀病毒學生，可通報衛生局或撥打1922協助，並進行校安通報。
教育處蘇啟昌處長表示，目前全球不斷新增中國大陸新型冠狀病毒肺炎確診病例，為因應疫情變化中央流行疫情指揮中心會隨時調整流行地區、旅遊建議範圍，縣府亦會隨時依照中心發布之規定修正「澎湖縣政府所屬學校、幼兒園及補習班因應中國大陸新型冠狀病毒肺炎疫情防疫及健康管理措施」，使各校得以執行相關防疫措施。