自民國92年，馬公高中創校60周年起，每年於校慶典禮表揚傑出校友，至今已有154位校友當選傑出校友。今年為馬公高中創校77周年，共有11位校友當選，馬公高中將授予當選之傑出校友每人一座由藝術家許一男大師所設計的銅質獎座，109年的11座獎座是由108年當選的傑出校友賈樂吉（曾任澎湖縣警察局局長，現職桃園縣政府警察局主任秘書）所捐贈，今年也是第一次由校友認捐獎座，希望藉由這樣的活動，讓馬高培育出優質的馬高下一代。
各領域獲選的傑出校友共有11位，名單如下（同一領域依姓氏筆畫排列）：
政治類–李再立（現職台北市政府體育局局長）。
學術（教育）類–郭天佑（現職國立臺灣海洋大學兼任教授，曾任台北市澎湖縣同鄉會理事長）、黃肇國（國立馬公高中校長退休）、蔡光庭（澎湖居民姓氏源流研究文史工作者）。
法律(醫護)類–辛伊堯（現職辛家醫科診所負責人）、林天財（現任財團法人中華人權協會理事長、大成台灣律師事務所高夥暨執行主任）、陳立堅（現職陳立堅牙醫診所負責人）。
商(經)類–楊詠絮（現職信統電產股份有限公司總經理、長期投入社會公益及赤崁故鄉回饋）。
特殊才藝（其他）類–呂練（現任高雄市國立馬公高中校友會理事，長期協助推動校友會會務）、蔡福松（社會公益及地方文化推動、文史工作者）、謝聰明（書法家、詩人、散文作家、社會藝文教育推動）。
馬公高中創校已近80年，校友遍布各地，目前正規畫成立全國校友總會，現正進行校友問卷調查中，歡迎有意願加入的馬高校友可以到馬高官網-校園公告(公告單位：秘書室)查詢填寫。
馬公高中也將整修校史館，歡迎熱心校友提供和學校有關的照片、作業簿或其他和校史相關的文物等，若有以上資料文物願意提供學校者，可送至學校文書組（連絡電話06-9272342轉521張組長）。