生態專家指出，澎湖內灣海域只有單一潮口，海水置換率差，加上箱網養殖業者群聚於石泉、菜園、興仁、五德一帶海域，網具長期浸泡海中，網衣生長大量藻類及附著物，養殖業者使用洗網劑，以及大量飼料沉澱至海底，破壞內灣海域生態污染。
翁平勝表示，為清除附著於網具PE纖維網的藻類和附著物，他聘請人力每半個月清洗一次，耗時又費力，現在已逐步汰換為強度6倍的防彈纖維網，雖然價格貴1倍，但材質柔軟，藻類不易附著，洗網週期延長為三個月，安全又節省養殖場三分之一人力。
翁平勝說，20年前曾試驗1次使用洗網劑清洗網具，但洗一件網具需花費5萬元洗網劑，不符成本，現在已不再使用洗網劑清洗。由於魚飼料價格上漲，目前投餵飼料已改為一天一次，沒有大量投擲飼料現象。
賴峰偉表示，箱網養殖、海上遊憩平台、家庭與事業污水若處理不慎，其產生的污染將衝擊內灣生態，若不及時擬訂措施管理，內灣生態資源逐漸凋零，澎湖就會像活在死海的島嶼，他呼籲全民重視海洋生態，共同努力活化海洋。
賴峰偉指出，內灣有許多箱網養殖，外界關切業者大量投擲飼料、洗網劑，出現養殖飼料沉積底泥，以及洗網劑污染海洋，他指示農漁局不定時、不定期派員巡迴檢查業者是否使用洗網劑汙染海洋。
△賴峰偉視察內灣箱網養殖。
△養殖業者現場示範用高壓水槍清洗網具節省成本又高效。