威靈殿地方慣稱「後窟潭宮」，依據廟內現懸掛一方乾隆40（1775）年之「萬古瞻依」匾，推測創建於18 世紀下半葉。威靈殿原奉祀福德正神，傳說乾隆年間瘟疫盛行，池府王爺代天巡狩出巡至後窟潭時駐蹕為百姓清除瘟疫，居民感念塑神像膜拜，也因為池府王爺神威顯赫，將廟命為「威靈殿」。
目前可知威靈殿歷經約4~5次修(增)建，而1969~1973年的重建，由謝自南設計、謝經義(2019年國家工藝成就獎)承作木雕，並參考臺灣廟宇，改以鋼筋水泥形式建成，也將昭和10年的石雕、首任馬公鎮長高恭的石雕蟹蘭圖應用在建築上。
本次廟方重建亦將這些構件保存下來，無論在歷史、文化及藝術各方面，重光威靈殿的文物皆具有珍貴的時代意義。
文化局希冀大家一同來認識威靈殿的文化資產，特於109年於澎湖生活博物館入口櫥窗辦理「重振威靈、光昭日月-重光威靈殿的歷史與文物」展示；並訂於109年1月18日(六)上午10時於澎湖生活博物館地下1樓多媒體簡報室由王文良老師主講「重振威靈、光昭日月-從工藝之美認識重光威靈殿」講座，本講座請事先於文化局網站(訊息公告/活動訊息)報名，限額100名。本活動相關資訊請洽:文化局博物館科簡先生9210405轉6409。
△位於威靈殿虎邊窗上的「光昭日月」題字。